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这个问题让我想起了前几年特别热门的一部电影，叫做《盗梦空间》，这里面有多重梦境。比如现实中5分钟，梦里可能会有一个多小时，第二层梦又是成指数增长。第三层梦相应增加时间，到了第四、第五层梦境，也许现实做梦时间才1个小时，但是梦里却过了整整一生。
在现实生活中，确实会出现做梦时间比较短，但是梦境时间有点长的情况。科学家们对于这个现象有不同的猜想，有些科学家怀疑是人体在梦境中无法感受运动中的肌肉反馈，所所以大脑处理动作需要的时间会延长。还有些科学家会怀疑是不是因为人体在睡眠时，大脑的温度较低、神经处理速度较慢，所以导致梦境时间比较长。
事实上60年以前，就有科学家对于这个现象非常感兴趣，在1957年的时候，来自芝加哥大学的William Dement和Nathaniel Kleitman做了一个实验：他们在不同的做梦睡眠阶段（也就是所谓的REM阶段）唤醒他们的试验者，或是5分钟之后或者15分钟之后。然后测试者需要估计自己做了多长时间的梦。统计显示有86%的人估计对了。那么为什么14%的人说得不对呢，1975年的时候，前苏联的科学家又进行深入研究，他们的解释是因为对于情景跳跃的梦我们会倾向于过长的估计做梦的时间。
后来来自海德堡大学的Daniel Erlacher对那些清醒做梦者（Wachträumer）进行了实验。清醒做梦者是指那些可以让自己进入做梦状态，但同时自己又是能清醒地意识到自己在做梦的人。他们在做梦状态时要求数21到25，或者做深蹲运动。
结果令人惊讶：在梦中数数字所用的时间和在现实生活中几乎一样长，但是在梦中做运动练习所经历的时间则比现实生活的时间长50%。而这也侧面印证了我们在上面提到的有些科学家怀疑是人体在梦境中无法感受运动中的肌肉反馈，所所以大脑处理动作需要的时间会延长。
其实这样的情形很容易发生在课堂上瞌睡时，觉得睡了好久，结果只有几分钟。不仅会有题主所说的这种情形，还有另一种相对的情形，有时候早晨赖床时觉得只是稍微贪睡了几分钟，结果一惊觉发现过了一个多小时。之所以会出现这样的现象，是因为这两种不同的情形下陷入的是不同的“睡眠”模式。
从心理学角度，人类是处于睡眠状态还是觉醒状态，取决于大脑中睡眠与觉醒两个相互对抗系统之间的平衡。一个系统由促进睡眠的神经回路和神经介质组成；另一个系统是由脑细胞组成的网络，对其他化学物质起反应并抑制睡眠。这两个系统活动的交替使脑从睡眠转换到觉醒，又从觉醒转换成睡眠。因此，即使一个睡眠充足的学生，在听枯燥的课程时仍然可能会瞌睡；而从事着自己感兴趣的活动，即使明显缺乏睡眠，有时候也不会觉得困乏。
在课堂上瞌睡，感觉到似乎过了5分钟，但其实只过了1分钟。这时候陷入的睡眠状态被称为“微睡眠”（microsleep），它是大脑在短暂的时间内进入正常睡眠时的状态。例如，疲劳的司机在驾驶车时即使一直睁着眼，有时也可能睡着了几秒。
在课堂上，由于意识到睡觉是不被允许的，而且一旦真的睡着就可能带来负面的社会性评价。因此，在困乏而又不能睡着的压力下，一个疲倦的学生很容易就陷入微睡眠状态，即使他睡着的时间只有数秒，但他也确实在这几秒内是睡着了的。因此，从感觉上，个体会觉得自己睡了好一会儿，实际上却只有不足1分钟。如果学生很疲倦，而课堂的讲授又实在枯燥乏味，同时睡着的后果又很严重，那么这个困乏的学生可能会反复地进入微睡眠。
而在家里放松地睡眠，比如躺在床上的“回笼觉”，感觉只稍微贪睡了1、2分钟，而实际上却可能过了半个多小时。这种情况下，个体是在经历正常的睡眠周期。人类的睡眠周期通常分为4个阶段，第一阶段为轻度睡眠（light sleep），此时人失去意识，进入睡眠，如果这时候被唤醒，他可能会报告自己睡着了，也可能说自己没睡着。这个阶段是从觉醒到深度睡眠的过渡阶段。
睡眠的第二个阶段在脑电波会出现独特的睡眠锭（sleep spindle），它是睡眠与觉醒的真正分界。研究发现，如果在出现睡眠4分钟后唤醒被试，大多数人都会报告说他们睡着了。像赖在床上半个小时的“回笼觉”，大体上就处于睡眠的这两个阶段。由于从睡眠第一个阶段开始，人们就开始失去意识，因此对失去意识的人来说，根本就不能准确估计到底睡了多长时间。而感觉只稍微睡了1、2分钟，这个估计通常反映的很可能只是赖床者的自我预期或暗示：“我再多睡1、2分钟。
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