日本国内并没有严格意义上官方发布的本国大学排名，所以个以参考国际排名以及日本国内高考难度和就业指标对各大学的印象大致分级，可分为S级到F级。
【S】:东京大学、京都大学、一桥大学、 东京工业大学；
【A+】:大阪大学、名古屋大学、东北大学；【A】:九州大学、北海道大学、庆应义塾大学、早稻田大学、筑波大学；
【B+】:广岛大学、神户大学、上智大学、东京理科大学、横滨国立大学；【B】:青山学院大学、明治大学、法政大学、同志社大学、关西学院大学；【B-】:千叶大学、熊本大学、大阪市立大学、学习院大学、中央大学、立教大学、立命馆大学、关西大学；
【C+】:金泽大学、长崎大学、首都大学、东京电气通信大学、东京艺术大学、御茶水女子大学、 大阪教育大学、京都工艺纤维大学、名古屋工业大学、日本大学、东京学艺大学；【C】:埼玉大学、新泻大学、静冈大学、东京农工大学、九州工业大学、横滨市立大学、大阪府立大学、北九州市立大学、京都教育大学、名古屋市立大学、东京海洋大学、国际教养大学、神户市外国语大学、兵库县立大学、爱知县立大学、香川大学、鹿儿岛大学、三重大学；【C-】:明治学院大学、专修大学、滋贺大学、信州大学、群马大学、茨城大学、京都府立大学、南山大学、成蹊大学。
日本私立大学排名TOP15的学校有哪些
第一名 庆应义塾 （亚洲第一私立学府，想必日本曾经有两部神剧，一部是差生考入东京大学、另一部就是考入庆应义塾了）
二名 早稻田大学 （家喻户晓无人不知、先进理工学部偏差值高达68）
三名 上智大学 （国际一流、校内还有校花评选）
四名 东京理科大学 （完全的理工科大学、日本科技的引领者、东京大学理科生的保底私立校）
五名 明治大学 （经济理工农皆首屈一指）
六名 立教大学 (文科学子的天堂、文科eju分数接近700）
七名 青山学院大学 （文理兼备、日本第一お洒落なキャンパス)
八名 同志社大学 （关关同立第一、西日本老大哥）
九名 中央大学 （法学部日本第一）
十名 关西学院大学（关关同立国际学部、经济学部日本一流、出世御三家、东京都市长母校）
十一名 立命馆大学 （关关同立 持续上升、人气爆棚、仓木麻衣 、中国外交部部长王毅留学）
十二名 学习院大学 （极度偏文 理学部不收外国人 gmarch）
十三名 法政大学 （极度偏文 march）
十四名 关西大学 （关关同立第4）
十五名 近畿大学（人工金枪鱼世界第一例 日本受验生第一）
日本大学排名的日本大学排名
综合国立大学、公立大学、私立大学多角度排名（非仅学术排名），仅供参考 【A1】：东京工业大学 一桥大学 庆应义塾大学
【A2】：大阪大学 东北大学 名古屋大学
【A3】：九州大学 北海道大学早稻田大学 【B1】： 神户大学 东京外国语大学 筑波大学
【B2】：横滨国立大学千叶大学广岛大学御茶水女子大学
【B3】：首都大学东京东京学艺大学大阪外国语大学（现为大阪大学外国语学部）大阪市立大学上智大学同志社大学 【C1】：金泽大学冈山大学熊本大学电气通信大学东京艺术大学大阪教育大学京都工艺纤维大学 名古屋工业大学东京理科大学明治大学青山学院大学关西学院大学立教大学
【C2】：埼玉大学新泻大学静冈大学 中央大学奈良女子大学东京海洋大学东京农工大学九州工业大学横滨市立大学大阪府立大学京都教育大学名古屋市立大学 学习院大学立命馆大学【C3】：法政大学 关西大学 明治学院大学 专修大学 滋贺大学 信州大学 群马大学茨城大学 京都府立大学小樽商科大学 南山大学成蹊大学 东洋大学 驹泽大学 国士馆大学 东海大学 龙谷大学甲南大学武藏大学东京都市大学等
地方国公立大学、首都圈京阪神地区中日本地区各大中坚私立大学、专业性理工科大学等近50所大学 环太平洋大学联盟（Association of Pacific Rim Universities），简称APRU，是环太平洋地区各国著名大学的联合学术组织。联盟目前共有37所会员学校。其中，中国大陆共有6所会员大学（北京大学、清华大学、复旦大学、南京大学、中国科学技术大学和浙江大学）。
日本的6所会员大学则为：
东京大学
京都大学
庆应义塾大学
早稻田大学
大阪大学
东北大学
RU11，全称学术研究恳谈会，是日本的一个顶尖大学间设立的学会，由11所专注于科学研究和培养高水平人才，并正在世界参与激烈学术竞争的日本顶尖国立、私立研究型大学组成。
2009年（平成21年），该学会由东京大学、京都大学、庆应义塾大学、早稻田大学、大阪大学、东北大学、名古屋大学、北海道大学、九州大学共同创立。2010年（平成22年），筑波大学和东京工业大学也先后加入了该学会，形成了由这11所日本顶尖高校组成的学会。
2014年，37所高校被日本文部科技省选定为以世界顶级教育，研究为目标的“超级国际化大学”。文部科学省把超级国际化大学分为两类：第一类大学以进入世界排名前100位，成为具有国际领先的教育、研究水平的大学为目标。第二类大学为愿意引进和实施新的教育体制，以促进日本国内社会的国际化为目标。
第一类大学（A类，顶尖型，共13所）：
东京大学
京都大学
早稻田大学
庆应义塾大学
东京工业大学
大阪大学
东北大学
名古屋大学
九州大学
筑波大学
北海道大学
广岛大学
东京医科齿科大学
第二类大学（B类，国际化牵引型，共24所）：
千叶大学 东京外国语大学 东京艺术大学 长冈技术科学大学
金泽大学丰桥技术科学大学京都工艺纤维大学
奈良先端科学技术大学院大学冈山大学熊本大学国际教养大学会津大学
国际基督教大学芝浦工业大学上智大学东洋大学法政大学明治大学
立教大学创价大学国际大学立命馆大学关西学院大学 立命馆亚洲太平洋大学 日本G30是指日本文部科学省于2009年开展了名为Global 30（留学生30万人计划，简称G30）的英文授课项目，共有13所一流大学参与其中。
东京大学，京都大学，早稻田大学，庆应义塾大学，大阪大学，九州大学，名古屋大学，东北大学，筑波大学，上智大学，明治大学，立命馆大学，同志社大学
